一般纳税人老板跑了不欠税款国税注销了地税因为连续三个月没有申报，变非正常户了，对会计有什么影响吗？

对会计没大的影响。会计应该把情况向税务局说清楚，否则今后会受到税务局的“特别关照”，呵呵

怎样办理公司税务注销 不办理会有什么严重后果吗

公司开不下去了，不注销的不良后果：
第一，公司歇业后未办理注销登记，也无清算组织负责清理债权债务的，公司和清算主体为共同诉讼主体；公司歇业后，虽办理注销登记，但无清算组织负责清理债权债务的，负有清算之责的主体为诉讼主体。因此，只有经过合法的清算、注销程序，公司才能从法律意义上消灭，公司及负有清算责任的清算主体才能免除相关的法律责任。
第二，如果公司不正常注销，也不按规定参加工商年检，将被工商局吊销营业执照，被吊销公司之法定代表人、股东将被工商局列入监控黑名单，在三年内无法再注册公司；银行个人信用记录不良将保持七年，而且要被罚款；税务则永久被列入监控黑名单，如再注册公司，将被税务机关追溯补税罚款。
由此可见，如果因为自己一时意气而对自己以后的事业产生不良影响是不智的行为，这样一来对自身的发展也是极为不利的，且自己的诚信记录会大受影响。换句话说，只有当完成了注销，公司才在法律意义上不存在。